在回鹘时期，维吾尔族的先祖们主要从事畜牧业生产活动，840年回鹘汗国解体以后，一部分维吾尔族人西迁到今天新疆及中亚地区以后，向当地原有居民学习，逐渐从畜牧业生产为主转变为以农业生产为主。他们种植小麦、大麦、水稻、豆类、芝麻等各类作物，瓜果的种植非常有名。千百年来维吾尔族人民种植和培育了不少驰名中外的优良瓜果品种，主要有哈密瓜、吐鲁番葡萄、库尔勒香梨、叶城石榴、伊犁苹果等。 
新疆是我国种植棉花最早的地区，早在公元5—6世纪，吐鲁番一带的维吾尔族人已经广泛种植棉花，并用棉花纺织。新疆最早引进和长期栽培的棉花品种是非洲棉。 
蚕桑的养殖和丝绸织造技术，也是古代维吾尔族人的重要成就。